卢珊年，全球首例人类卵子体外受精（invitrofertilization,IVF）婴儿出生[1]，由于其受精过程在实验室进行，这些孩子被形象地称为“试管婴儿”。至今四十多年，全球估计已有万例通过IVF及其改良技术实现的妊娠[2]。随着技术的发展，这些辅助生殖技术（assistedreproductivetechnology,ART）已经发展出多种改良，卵细胞浆内单精子注射（intracytoplasmicsperminjection,ICSI）、配子输卵管移植（gameteintrafallopiantransfer,GIFT）及合子输卵管移植（zygoteintrafallopiantransfer,ZIFT）[3]。根据美国生殖医学会（AmericanSocietyforReproductiveMedicine，ASRM）的定义，代孕（Surrogacy）指能孕女性接受委托，同意将他人的胚胎（受精卵）植入自己的子宫，由自己代替他人孕育、分娩新生儿的法律行为，该孕母不提供卵子，因此与孩子在生物学上（遗传上）无关[4]。不论是否
接下来小编对部分单细胞测序文章进行了导读，为大家带来单细胞研究的新思路。
标题：MAFG-drivenastrocytespromoteCNSinflammation
发表期刊：Nature
影响因子：43
DOI：10./s---0
摘要：
多发性硬化症是一种中枢神经系统慢性炎症性疾病。星形胶质细胞促成了多发性硬化症的发病，但对星形胶质细胞的异质性及其调控机制却知之甚少。本文通过单细胞转录组测序结合细胞特异性RibotagRNA分析、转座酶及染色质测序分析(ATAC-seq)、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、DNA甲基化全基因组分析及基于CRISPR-Cas9技术的体内遗传干扰技术进行了多发性硬化症及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)临床前模型中星形胶质细胞的分析。
本文确定了多发性硬化症和实验性自身免疫性脑脊髓炎中星形胶质细胞的特点：通过减少NRF2增加MAFG的表达；与MAT2α合作促进DNA甲基化；抑制抗氧化和抗炎转录程序。本研究结果确定了多发性硬化症的候选治疗靶点。
标题：PeripheralTcellexpansionpredictstumourinfiltrationandclinicalresponse
发表期刊：Nature
影响因子：43
DOI：10./s---8
摘要：
尽管阻断PD-1与配体PD-L1相互作用的抗体在癌症治疗中取得了显著的成功，但其机制仍不清楚。了解T细胞在肿瘤免疫中的起源和命运的一个主要限制是缺乏关于癌症患者个体克隆型T细胞分布的定量信息。在此，通过对不同类型癌症患者的RNA和T细胞受体进行深度单细胞测序，调查了肿瘤、正常邻近组织和外周血中不同人群的T细胞和T细胞受体的概况。
在这些组织内存在效应样T细胞克隆型扩增的明确证据。具有这种克隆型扩增基因特征的患者对抗PD-L1治疗反应最好。值得注意的是，在肿瘤和正常邻近组织中发现的克隆型通常也能在外周血中检测到，该结果有利于开发更为方便的检测方法。
标题：PeripheralCD8+Tcellcharacteristicsassociatedwithdurableresponsestoimmunecheckpointblockadeinpatientswithmetastaticmelanoma.
发表期刊：NatureMedicine
影响因子：31
DOI：10./s---6
摘要：
PD-1和CTLA-4的免疫检查点阻断(ICB)治疗转移性黑色素瘤(MM)疗效不一。为了研究这一问题，研究人员对一组接受单抗PD-1(sICB)或联合抗CTLA-4的MM患者的CD8+T细胞基因表达进行了描述。尽管CD8对sICB和cICB的转录应答涉及一个共享的基因集，但cICB应答的幅度要大4倍以上，优先诱导与有丝分裂和干扰素相关的基因。早期临床受益患者的样本显示编码T细胞受体的基因过表达。
8个处理后样本的单细胞转录组测序结果表明，克隆过表达基因涉及细胞*性和效应记忆T细胞的特征，包括CCL4、GNLY和NKG7。MM患者对ICB6个月的临床反应与治疗后第21天CD8T细胞的大量克隆有关，这表明ICB后外周血CD8克隆性可以提供关于长期治疗反应的信息，并可能促进治疗分层。
标题：TheRepertoireofSerousOvarianCancerNongeneticHeterogeneityRevealedbySingle-CellSequencingofNormalFallopianTubeEpithelialCells
发表期刊：Cancercell
影响因子：24
DOI：10./j.ccell.2.01.
摘要：
细胞状态间的相互分化促进了癌细胞在压力下的生存，并促进了非遗传异质性(NGH)。因此，NGH可作为肿瘤弹性恢复力的替代物，但其定量受到遗传异质性的干扰。本研究证实，当被告知正常细胞来源的分子特征时，NGH是可以精确测量的。
研究调查了约个正常输卵管上皮细胞(FTE)的转录组，这些细胞是浆液性卵巢癌的起源细胞(SOC)，并确定了六个FTE亚型。对SOC表达数据去卷积，发现了大量以前未被识别的肿瘤内生长激素。重要的是，基于NGH的个肿瘤细胞的分层有效地预测了存活率。本研究的发现为SOC的准确预后和治疗奠定了基础。
标题：ReconstructedSingle-CellFateTrajectoriesDefineLineagePlasticityWindowsduringDifferentiationofHumanPSC-DerivedDistalLungProgenitors
发表期刊：CellStemCell
影响因子：21
DOI：10./j.stem.2.12.
摘要：
2型肺泡上皮细胞(AEC2s)是兼性祖细胞，负责维持肺泡，但很难从患者中分离出来。本研究从体外培养的人多能干细胞(PSCs)中提取AEC2s，并使用单细胞转录组测序来分析其与原代胎儿和成年AEC2的动力学差异。
本研究建立了一个连续状态的HiddenMarkov模型来识别信号的时间和类型，如过度兴奋的Wnt反应，这些信号会导致一些早期的多功能NKX2-1祖细胞失去肺命运。最后，研究发现这种最初的发育可塑性是可调节的，并随着时间的推移而减弱，最终导致人多能干细胞衍生的AEC2s表现出稳定的表型和几乎无限的自我更新能力。
标题：MechanismsofFibrosisDevelopmentinNASH
发表期刊：Gastroenterology
影响因子：19
DOI：10./j.gastro.2.11.
摘要：
非酒精性脂肪肝(NAFLD)是全世界最常见的肝病，影响20-25%的成年人。25%的NAFLD患者会发展为非酒精脂肪性肝炎(NASH)，这增加了肝硬化、肝功能衰竭和肝细胞癌的风险。在NASH患者中，肝纤维化是死亡的主要因素。
本文回顾了NASH中不同肝细胞之间的相互作用如何导致纤维化发展，讨论了肝细胞-巨噬细胞-肝星状细胞(HSC)串扰的触发因素和后果。本文将讨论应激和死亡肝细胞与HSC和巨噬细胞发生原纤维性相互作用的途径，包括TAZ、Notch和hedgehog等途径的重新激活；脓*症患者死细胞的清除如何影响炎症和纤维形成；并通过单细胞转录组测序揭示HSC和巨噬细胞的异质性。最后，文章将总结在NASH中阻断促纤维化肝-巨噬细胞-HSC网络的治疗方法。
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